SMA Negeri 3 Jember secara rutin cek kesehatan oleh para guru dan karyawan serta seluruh siswa. Tes kesehatan (medical check up) dilakukan secara berkala untuk mengetahui kondisi kesehatan terbaru, sehingga penyakit bisa dicegah sejak dini. Adapun yang di cek kesehatanya antara lain mengukur tinggi badan,meinmbang badan,tes kesehatan mata, tes tekanan darah,cek gula darah,cek asam urat,cek kolesterol,cek telinga,mata,mulut. Pemeriksaan kesehatan itu juga berfungsi untuk menentukan asupan makan yang diperlukan atau dihindari, perbaikan pola hidup, dan perbaikan lainnya pada tubuh mengacu pada hasil pemeriksaan kesehatan.