Untuk menunjang layanan bimbingan dan konseling siswa, SMAN 3 Jember memiliki ruangan BK yang cukup besar dan memadai.
Di dalam ruangan ini terbagi menjadi ruang utama, ruang konseling pribadi, ruang konseling kelompok (merangkap tempat sholat), dan juga ruang tamu.
Ruang BK juga difasilitasi dengan 2 komputer yang dilengkapi akses internet, 1 komputer khusus untuk administrasi BK dan 1 komputer yang bisa digunakan oleh siswa jika membutuhkan, misal untuk keperluan administrasi perguruan tinggi dan sejenisnya.